在信息爆炸時代，是否充分利用電子商務成為中小企業成敗的關鍵。“沒有電子商務，企業就只能等待死亡！”或許有些偏激，但確實是企業發展壯大的基本。但在中小企業運用電子商務的過程中，會遇到一些問題，將影響到中小企業的電子商務的實施。
首先，對電子商務認識不足的問題
許多中小企業管理基礎落后，領導信息化意識不強，也沒有充分認識到知識經濟時代搶占信息市場的重要性。或者對如何開展電子商務理解比較片面，如認為電子商務就是上網，或簡單地建一個網站，而相關的管理基礎卻沒有跟上，企業的電子商務僅停留在表面的網站建設上。因此中小企業不但在觀念上要重視電子商務，而且要了解電子商務的實質，不宜盲目跟風。
此外，電子商務不單是一個企業的事情。中小企業供應鏈的管理能力欠缺，如何和供應鏈的核心企業合作，借助其平臺或第三方共享交易平臺開展業務也是中小企業開展電子商務的重要話題。
其次，設施落后的問題
中小企業使用互聯網和參與電子商務的程度參差不齊。據統計，目前參與電子商務的企業僅為25%左右，在眾多的行業用戶中，汽車行業、電子行業和貿易行業等信息化建設水平較高。但在這些領先的行業，電子商務的應用也極不平衡，很多網站都不成熟，如網站建設目的不明確，不知道目標用戶是誰，不能反映出企業的形象，網站功能簡陋，用戶找不到自己需要的信息，用戶的咨詢也常常得不到回復等。有些企業雖然建立了網站，但過于關注于傳統業務，網站利用率極低，甚至成為一個空殼。
由于資源有限，許多中小企業需要把主要精力集中放在業務上，難以投入足夠的資源進行信息化建設。但中小企業普遍對采購、生產、庫存、銷售、財務和人事等方面的應用有一定需求，應用服務提供商模式ASP就成為中小型企業開展電子商務的選擇。就目前ASP的發展情況而言，由于觀念、安全等方面的因素影響，ASP在國內的發展并不讓人滿意。
第三，執行不力的問題
由于中小型企業管理者還未充分認識到電子商務給企業發展，營銷手段帶來的革命性變化，因此對人才的培養沒有足夠的重視，導致電子商務人才的匱乏。中小型企業開展電子商務既要技術又要人才，但這方面的人才在大企業也不是很充裕。專業人員的不足，電子商務模式缺乏創新，導致中小型企業缺乏網絡經營的經驗，電子商務的優越性表現不出來，許多中小型企業涉足電子商務心有余力不足。
資金短缺是中小企業的普遍困難。在有限資金的合理使用方面，許多中小企業尚處于摸索階段。很多中小企業對硬件的投資占到整個信息化投資80％以上，而配套軟件和IT服務等方面投入相對滯后，對軟件的選型不恰當，咨詢合作伙伴協調不力，最終會使企業的投資回報率低，難以獲得持久的發展動力。
第四、缺乏規劃的問題
中小型企業開展電子商務往往缺乏長遠規劃，比較注意短期效益。電子商務涉及業務轉型，不同企業發展電子商務的方式也是不同的。從利用互聯網瀏覽、收集、發布信息，到建立企業網站，建立信息平臺，實施網上采購，再到建立行業聯合采購平臺，完善自己的供應鏈管理系統等，中小型企業電子商務的實施要逐步到位，長遠規劃，分步實施。
電子商務在我國的發展時間不長短，中小企業對實施電子商務發展戰略方面還缺乏深刻的認識，但是，“機不可失，時不我待”，在不以我們的意志為轉移的、勢不可擋的電子商務發展大潮面前，中小企業除了盡早實施電子商務以外，別無選擇。否則，遲早要被電子商務潮流所淘汰。
最后，全球化不足的問題
當今，全球電子商務的發展是不可逆轉的態勢。電子商務是世界經濟全球化和科技發展的必然產物，其發展勢頭不可阻擋，目前電子商務在技術上已初步具備實施條件，在美國的推動下，國際組織和發達國家政府相繼發表電子商務文件，而且從多邊貿易自由化發展的趨勢來看，不久將會有這方面的國際協議和規則出臺。而目前的電子商務國際談判主要集中在少數發達國家之間，發展中國家若不及時參與到對話中來，不利于形成電子商務的國際框架。
對于中小企業來說，要致力于產品技術含量的提高、附加值的增加，最重要的是要增強企業的全球意識。飛揚動力認為，企業要真正地實施全球化戰略，最緊迫的是提高企業的信息化程度。在融入國際市場后，已經有相當多的中小企業認識到，網站的建設尤其是直接針對客戶的英文網站的建設，將成為企業業務增長的一個關鍵因素；同時也是企業區別于其他同行，建立自身品牌的重要平臺。而中小企業從網站的建立到托管再到維護這之間花費的金錢，與在信息化程度提高、客戶來源更廣、品牌價值提升后獲得的利潤相比，根本不值一提。正是意識到了網絡的重要性，中小企業的英文網站紛紛地建了起來。
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